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Em 2017, após a demissão do então técnico Levir Culpi, nas quartas de final da Libertadores, contra o Barcelona-EQU, Elano comandou a equipe até o final do Campeonato Brasileiro. O Peixe encerrou a temporada na terceira colocação. Em 2020, já como treinador, Elano encarou o Santos na Vila Belmiro, quando comandava a Internacional de Limeira. O jogo terminou com vitória santista por 2 a 0, com dois gols marcados pelo atacante Raniel.

O ex-meia do Peixe ainda treinou o Figueirense, Náutico e Ferroviária. Elano estava sem clube e atuando como comentarista de uma emissora de TV até receber, e aceitar, o convite do Guarani para retornar ao futebol.